Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALML4Q96GE6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALML4Q96GE6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALML4Q96GE6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALML4Q96GE6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALML4Q96GE6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALML4Q96GE6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CALML4Q96GE6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CALML4Q96GE6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALML4Q96GE6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALML4Q96GE6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALML4Q96GE6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALML4Q96GE6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALML4Q96GE6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CALML4Q96GE6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALML4Q96GE6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms