Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTD1Q8N815 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNTD1Q8N815 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms