Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.79■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.79■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.79■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LTBP4Q8N2S1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LTBP4Q8N2S1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LTBP4Q8N2S1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms