Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP3Q8IZU3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms