Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR53Q7Z5U6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR53Q7Z5U6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms