Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFYVE27Q5T4F4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFYVE27Q5T4F4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFYVE27Q5T4F4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFYVE27Q5T4F4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFYVE27Q5T4F4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFYVE27Q5T4F4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFYVE27Q5T4F4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFYVE27Q5T4F4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFYVE27Q5T4F4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFYVE27Q5T4F4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms