Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUD3Q5T2D3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD3Q5T2D3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD3Q5T2D3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms