Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TREML2Q5T2D2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TREML2Q5T2D2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TREML2Q5T2D2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TREML2Q5T2D2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms