Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WASHC2DQ5SRD0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WASHC2DQ5SRD0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms