Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX2Q3B8N5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROX2Q3B8N5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PROX2Q3B8N5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms