Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85BQ15834 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85BQ15834 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85BQ15834 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85BQ15834 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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