Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF11Q15544 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF11Q15544 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF11Q15544 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms