Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKP2Q13309 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms