Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIGQ13278 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIGQ13278 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIGQ13278 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIGQ13278 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIGQ13278 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIGQ13278 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIGQ13278 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIGQ13278 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIGQ13278 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIGQ13278 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIGQ13278 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIGQ13278 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIGQ13278 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIGQ13278 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIGQ13278 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIGQ13278 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIGQ13278 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIGQ13278 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIGQ13278 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIGQ13278 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RIGQ13278 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIGQ13278 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIGQ13278 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIGQ13278 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIGQ13278 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIGQ13278 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIGQ13278 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIGQ13278 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RIGQ13278 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIGQ13278 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIGQ13278 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIGQ13278 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIGQ13278 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIGQ13278 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIGQ13278 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIGQ13278 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIGQ13278 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIGQ13278 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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