Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACACAQ13085 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACACAQ13085 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACACAQ13085 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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