Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMX1Q04741 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMX1Q04741 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EMX1Q04741 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMX1Q04741 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMX1Q04741 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMX1Q04741 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMX1Q04741 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMX1Q04741 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMX1Q04741 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMX1Q04741 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMX1Q04741 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMX1Q04741 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMX1Q04741 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EMX1Q04741 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMX1Q04741 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMX1Q04741 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMX1Q04741 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMX1Q04741 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX1Q04741 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX1Q04741 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMX1Q04741 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMX1Q04741 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMX1Q04741 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMX1Q04741 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMX1Q04741 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMX1Q04741 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMX1Q04741 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMX1Q04741 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMX1Q04741 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMX1Q04741 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMX1Q04741 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMX1Q04741 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMX1Q04741 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMX1Q04741 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMX1Q04741 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMX1Q04741 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMX1Q04741 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMX1Q04741 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMX1Q04741 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX1Q04741 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMX1Q04741 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMX1Q04741 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX1Q04741 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMX1Q04741 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms