Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2C1P98194 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP2C1P98194 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2C1P98194 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms