Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CNTNAP1P78357 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP1P78357 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP1P78357 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms