Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP107P57740 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP107P57740 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP107P57740 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP107P57740 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP107P57740 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP107P57740 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP107P57740 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP107P57740 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP107P57740 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP107P57740 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP107P57740 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP107P57740 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP107P57740 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP107P57740 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP107P57740 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP107P57740 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP107P57740 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP107P57740 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP107P57740 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP107P57740 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP107P57740 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP107P57740 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP107P57740 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP107P57740 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP107P57740 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP107P57740 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP107P57740 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP107P57740 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP107P57740 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP107P57740 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP107P57740 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP107P57740 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP107P57740 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP107P57740 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP107P57740 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP107P57740 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP107P57740 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP107P57740 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP107P57740 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP107P57740 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP107P57740 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP107P57740 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP107P57740 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP107P57740 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP107P57740 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP107P57740 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP107P57740 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP107P57740 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP107P57740 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP107P57740 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP107P57740 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP107P57740 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP107P57740 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP107P57740 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP107P57740 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP107P57740 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP107P57740 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP107P57740 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP107P57740 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP107P57740 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP107P57740 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP107P57740 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms