Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN5P54829 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN5P54829 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN5P54829 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms