Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSFMP43897 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSFMP43897 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSFMP43897 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSFMP43897 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSFMP43897 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSFMP43897 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSFMP43897 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSFMP43897 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSFMP43897 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSFMP43897 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSFMP43897 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSFMP43897 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSFMP43897 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSFMP43897 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSFMP43897 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSFMP43897 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSFMP43897 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSFMP43897 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSFMP43897 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSFMP43897 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSFMP43897 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSFMP43897 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSFMP43897 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSFMP43897 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSFMP43897 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSFMP43897 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSFMP43897 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSFMP43897 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSFMP43897 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSFMP43897 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSFMP43897 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSFMP43897 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSFMP43897 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSFMP43897 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSFMP43897 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSFMP43897 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSFMP43897 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSFMP43897 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSFMP43897 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSFMP43897 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSFMP43897 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSFMP43897 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSFMP43897 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSFMP43897 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSFMP43897 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSFMP43897 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSFMP43897 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSFMP43897 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSFMP43897 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSFMP43897 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSFMP43897 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSFMP43897 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSFMP43897 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSFMP43897 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSFMP43897 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSFMP43897 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSFMP43897 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSFMP43897 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSFMP43897 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSFMP43897 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSFMP43897 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSFMP43897 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSFMP43897 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSFMP43897 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSFMP43897 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSFMP43897 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSFMP43897 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSFMP43897 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSFMP43897 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSFMP43897 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSFMP43897 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSFMP43897 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSFMP43897 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSFMP43897 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSFMP43897 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSFMP43897 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSFMP43897 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSFMP43897 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSFMP43897 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSFMP43897 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSFMP43897 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSFMP43897 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSFMP43897 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSFMP43897 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms