Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRHP20396 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRHP20396 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRHP20396 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRHP20396 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRHP20396 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRHP20396 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRHP20396 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
TRHP20396 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRHP20396 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRHP20396 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
TRHP20396 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRHP20396 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRHP20396 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
TRHP20396 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRHP20396 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TRHP20396 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TRHP20396 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TRHP20396 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TRHP20396 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TRHP20396 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRHP20396 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRHP20396 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRHP20396 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRHP20396 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRHP20396 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRHP20396 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRHP20396 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRHP20396 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRHP20396 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRHP20396 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRHP20396 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRHP20396 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRHP20396 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRHP20396 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRHP20396 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRHP20396 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRHP20396 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRHP20396 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRHP20396 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRHP20396 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
TRHP20396 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRHP20396 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
TRHP20396 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
TRHP20396 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
TRHP20396 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
TRHP20396 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
TRHP20396 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
TRHP20396 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRHP20396 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRHP20396 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRHP20396 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRHP20396 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRHP20396 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRHP20396 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRHP20396 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRHP20396 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRHP20396 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRHP20396 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRHP20396 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
TRHP20396 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TRHP20396 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TRHP20396 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TRHP20396 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRHP20396 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRHP20396 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRHP20396 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRHP20396 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
TRHP20396 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
TRHP20396 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
TRHP20396 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRHP20396 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRHP20396 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRHP20396 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRHP20396 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
TRHP20396 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TRHP20396 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TRHP20396 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TRHP20396 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRHP20396 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRHP20396 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRHP20396 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRHP20396 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRHP20396 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRHP20396 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRHP20396 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRHP20396 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRHP20396 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRHP20396 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRHP20396 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRHP20396 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRHP20396 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
TRHP20396 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRHP20396 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRHP20396 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRHP20396 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRHP20396 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRHP20396 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRHP20396 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRHP20396 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms