Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNAP12004 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNAP12004 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNAP12004 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNAP12004 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNAP12004 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNAP12004 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNAP12004 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNAP12004 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNAP12004 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNAP12004 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNAP12004 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNAP12004 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNAP12004 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNAP12004 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNAP12004 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNAP12004 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNAP12004 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNAP12004 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNAP12004 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNAP12004 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNAP12004 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNAP12004 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNAP12004 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNAP12004 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNAP12004 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNAP12004 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNAP12004 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNAP12004 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNAP12004 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNAP12004 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNAP12004 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNAP12004 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNAP12004 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNAP12004 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNAP12004 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNAP12004 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNAP12004 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNAP12004 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNAP12004 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNAP12004 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNAP12004 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNAP12004 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNAP12004 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNAP12004 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNAP12004 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNAP12004 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNAP12004 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNAP12004 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNAP12004 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNAP12004 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNAP12004 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNAP12004 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNAP12004 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNAP12004 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNAP12004 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNAP12004 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNAP12004 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNAP12004 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNAP12004 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNAP12004 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNAP12004 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNAP12004 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNAP12004 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNAP12004 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNAP12004 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNAP12004 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNAP12004 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNAP12004 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNAP12004 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNAP12004 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNAP12004 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNAP12004 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNAP12004 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms