Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DMDP11532 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DMDP11532 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DMDP11532 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
DMDP11532 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
DMDP11532 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DMDP11532 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DMDP11532 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DMDP11532 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DMDP11532 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DMDP11532 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DMDP11532 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DMDP11532 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DMDP11532 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DMDP11532 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DMDP11532 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DMDP11532 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DMDP11532 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DMDP11532 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMDP11532 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMDP11532 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMDP11532 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMDP11532 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMDP11532 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DMDP11532 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DMDP11532 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DMDP11532 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DMDP11532 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DMDP11532 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DMDP11532 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DMDP11532 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DMDP11532 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DMDP11532 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DMDP11532 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DMDP11532 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DMDP11532 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DMDP11532 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DMDP11532 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DMDP11532 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DMDP11532 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DMDP11532 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DMDP11532 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DMDP11532 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DMDP11532 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DMDP11532 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DMDP11532 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DMDP11532 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DMDP11532 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DMDP11532 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DMDP11532 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DMDP11532 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DMDP11532 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DMDP11532 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DMDP11532 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DMDP11532 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DMDP11532 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DMDP11532 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DMDP11532 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DMDP11532 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DMDP11532 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DMDP11532 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DMDP11532 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DMDP11532 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DMDP11532 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DMDP11532 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DMDP11532 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DMDP11532 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DMDP11532 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DMDP11532 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DMDP11532 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DMDP11532 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DMDP11532 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DMDP11532 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DMDP11532 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DMDP11532 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DMDP11532 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DMDP11532 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DMDP11532 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DMDP11532 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DMDP11532 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DMDP11532 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DMDP11532 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DMDP11532 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DMDP11532 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DMDP11532 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DMDP11532 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DMDP11532 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DMDP11532 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DMDP11532 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DMDP11532 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DMDP11532 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DMDP11532 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DMDP11532 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DMDP11532 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DMDP11532 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DMDP11532 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DMDP11532 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DMDP11532 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DMDP11532 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DMDP11532 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms