Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRBP10828 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRBP10828 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRBP10828 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRBP10828 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRBP10828 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THRBP10828 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRBP10828 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRBP10828 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRBP10828 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRBP10828 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRBP10828 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRBP10828 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRBP10828 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRBP10828 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRBP10828 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THRBP10828 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRBP10828 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRBP10828 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRBP10828 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRBP10828 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRBP10828 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRBP10828 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THRBP10828 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THRBP10828 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRBP10828 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THRBP10828 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THRBP10828 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRBP10828 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THRBP10828 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRBP10828 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRBP10828 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRBP10828 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRBP10828 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THRBP10828 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
THRBP10828 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
THRBP10828 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THRBP10828 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THRBP10828 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRBP10828 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRBP10828 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THRBP10828 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRBP10828 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRBP10828 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRBP10828 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THRBP10828 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRBP10828 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRBP10828 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRBP10828 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRBP10828 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRBP10828 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRBP10828 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRBP10828 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THRBP10828 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRBP10828 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRBP10828 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRBP10828 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THRBP10828 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRBP10828 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRBP10828 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRBP10828 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRBP10828 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRBP10828 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THRBP10828 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRBP10828 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRBP10828 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRBP10828 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRBP10828 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRBP10828 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRBP10828 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRBP10828 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRBP10828 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRBP10828 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRBP10828 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THRBP10828 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRBP10828 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRBP10828 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRBP10828 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRBP10828 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRBP10828 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRBP10828 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRBP10828 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRBP10828 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THRBP10828 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THRBP10828 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THRBP10828 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THRBP10828 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THRBP10828 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THRBP10828 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THRBP10828 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THRBP10828 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THRBP10828 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THRBP10828 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THRBP10828 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THRBP10828 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THRBP10828 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THRBP10828 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THRBP10828 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THRBP10828 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THRBP10828 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.4 ms