Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3FO00303 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3FO00303 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EIF3FO00303 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms