Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFFAO00273 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DFFAO00273 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DFFAO00273 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DFFAO00273 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DFFAO00273 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFFAO00273 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFFAO00273 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFFAO00273 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFFAO00273 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFFAO00273 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFFAO00273 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFFAO00273 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFFAO00273 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFFAO00273 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFFAO00273 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DFFAO00273 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DFFAO00273 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DFFAO00273 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DFFAO00273 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DFFAO00273 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DFFAO00273 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DFFAO00273 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DFFAO00273 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DFFAO00273 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DFFAO00273 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DFFAO00273 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DFFAO00273 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DFFAO00273 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DFFAO00273 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DFFAO00273 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DFFAO00273 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DFFAO00273 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DFFAO00273 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DFFAO00273 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DFFAO00273 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DFFAO00273 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DFFAO00273 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DFFAO00273 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DFFAO00273 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DFFAO00273 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DFFAO00273 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DFFAO00273 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DFFAO00273 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DFFAO00273 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DFFAO00273 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DFFAO00273 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DFFAO00273 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DFFAO00273 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DFFAO00273 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DFFAO00273 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DFFAO00273 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DFFAO00273 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DFFAO00273 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DFFAO00273 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DFFAO00273 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DFFAO00273 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DFFAO00273 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DFFAO00273 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DFFAO00273 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DFFAO00273 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DFFAO00273 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DFFAO00273 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DFFAO00273 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DFFAO00273 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DFFAO00273 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DFFAO00273 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DFFAO00273 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DFFAO00273 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DFFAO00273 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DFFAO00273 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DFFAO00273 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DFFAO00273 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DFFAO00273 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DFFAO00273 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DFFAO00273 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DFFAO00273 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DFFAO00273 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DFFAO00273 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DFFAO00273 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DFFAO00273 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DFFAO00273 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DFFAO00273 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DFFAO00273 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DFFAO00273 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DFFAO00273 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DFFAO00273 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DFFAO00273 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DFFAO00273 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms