Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CAMTA1Q9Y6Y1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CAMTA1Q9Y6Y1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CAMTA1Q9Y6Y1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CAMTA1Q9Y6Y1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CAMTA1Q9Y6Y1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CAMTA1Q9Y6Y1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CAMTA1Q9Y6Y1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAMTA1Q9Y6Y1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAMTA1Q9Y6Y1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAMTA1Q9Y6Y1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAMTA1Q9Y6Y1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms