Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC2Q9Y235 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms