Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
PARP4Q9UKK3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PARP4Q9UKK3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PARP4Q9UKK3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PARP4Q9UKK3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms