Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1Q9UJ41 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RABGEF1Q9UJ41 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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