Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS29Q9UBQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS29Q9UBQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms