Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAE1Q9UBE0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAE1Q9UBE0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAE1Q9UBE0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms