Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0X4

CACNA1I, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1I, humanhuman

Predictions only

Length 2,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1IQ9P0X4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1IQ9P0X4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1IQ9P0X4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1IQ9P0X4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1IQ9P0X4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1IQ9P0X4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA1IQ9P0X4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA1IQ9P0X4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA1IQ9P0X4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA1IQ9P0X4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1IQ9P0X4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1IQ9P0X4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA1IQ9P0X4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1IQ9P0X4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1IQ9P0X4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1IQ9P0X4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA1IQ9P0X4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms