Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC10

OTOF, Otoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOFQ9HC10 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOFQ9HC10 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOFQ9HC10 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOFQ9HC10 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOFQ9HC10 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOFQ9HC10 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOFQ9HC10 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOFQ9HC10 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOFQ9HC10 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOFQ9HC10 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOFQ9HC10 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOFQ9HC10 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOFQ9HC10 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
OTOFQ9HC10 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.4 ms