Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-8Q9BYQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms