Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMUB1Q9BVT8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMUB1Q9BVT8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMUB1Q9BVT8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMUB1Q9BVT8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB1Q9BVT8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB1Q9BVT8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB1Q9BVT8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB1Q9BVT8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB1Q9BVT8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB1Q9BVT8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB1Q9BVT8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMUB1Q9BVT8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMUB1Q9BVT8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms