Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSEN34Q9BSV6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TSEN34Q9BSV6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSEN34Q9BSV6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms