Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD5Q99717 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMAD5Q99717 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD5Q99717 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms