Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS4Q96RK4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS4Q96RK4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms