Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ4

MSLNL, Mesothelin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNLQ96KJ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSLNLQ96KJ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSLNLQ96KJ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSLNLQ96KJ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSLNLQ96KJ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSLNLQ96KJ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms