Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLMNQ96JQ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLMNQ96JQ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLMNQ96JQ2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLMNQ96JQ2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms