Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRRFQ96E11 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRRFQ96E11 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRRFQ96E11 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.6 ms