Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V1E2Q96A05 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V1E2Q96A05 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V1E2Q96A05 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms