Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG4AQ8WYN0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4AQ8WYN0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4AQ8WYN0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms