Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DNAJA4Q8WW22 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms