Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC46.71■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC46.71■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC46.7■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC46.69■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
RB1CC1Q8TDY2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC46.65■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
RB1CC1Q8TDY2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
RB1CC1Q8TDY2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC46.53■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.53■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC46.52■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
RB1CC1Q8TDY2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.5■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.5■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC46.49■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC46.47■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.47■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC46.47■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.47■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC46.44■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC46.44■■■■■ 5.03
RB1CC1Q8TDY2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC46.43■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC46.42■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC46.41■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC46.41■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms