Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 218.01■□□□□ 0.475e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 KMT2D-202ENST00000526209 859 ntTSL 317.91■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.455e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SETD3-206ENST00000453764 973 ntTSL 517.65■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 317.6■□□□□ 0.415e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SEC61A2-213ENST00000475268 2183 ntTSL 1 (best)17.55■□□□□ 0.45e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.395e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 AKT2-228ENST00000537834 1402 ntTSL 217.43■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 CASC4-209ENST00000559222 742 ntTSL 317.39■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 316.99■□□□□ 0.315e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.315e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLC16A5-204ENST00000578376 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.95■□□□□ 0.35e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 CTNNA1-213ENST00000519113 859 ntTSL 316.8■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.275e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.275e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.275e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SEC61A2-209ENST00000441368 691 ntTSL 516.65■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 KIF2A-209ENST00000512541 549 ntTSL 416.55■□□□□ 0.245e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SPOP-220ENST00000515508 563 ntTSL 216.54■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.245e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.225e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.195e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SCPEP1-215ENST00000576154 1915 ntTSL 216.09■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SUGP1-210ENST00000589144 2066 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.115e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 CTNNA1-206ENST00000517980 696 ntTSL 415.65■□□□□ 0.15e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 315.59■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SUGP1-202ENST00000535070 1094 ntTSL 215.49■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SEC61A2-214ENST00000495368 2311 ntTSL 215.41■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SPOP-210ENST00000506399 918 ntTSL 515.35■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ECI2-208ENST00000478266 1133 ntTSL 515.27■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 AKT2-221ENST00000487537 954 ntTSL 215.25■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 PLOD3-206ENST00000454310 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.24■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.025e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SUGP1-206ENST00000587119 2177 ntTSL 215.15■□□□□ 0.025e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SUGP1-209ENST00000588731 2282 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 05e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 05e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SEC61A2-212ENST00000472221 850 ntTSL 215.06■□□□□ 05e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 WBP2-205ENST00000586257 676 ntTSL 315.02■□□□□ -05e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 INTS14-217ENST00000573314 2615 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.035e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 CCDC85C-206ENST00000557576 656 ntTSL 214.69□□□□□ -0.065e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SUGP1-204ENST00000585763 826 ntTSL 514.66□□□□□ -0.065e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 FNTA-205ENST00000526755 4676 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 AKT2-212ENST00000441941 974 ntTSL 414.49□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 STAG2-213ENST00000458700 296 ntTSL 514.36□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 RNF19A-204ENST00000519342 562 ntTSL 414.3□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SCPEP1-214ENST00000575423 1725 ntTSL 214.29□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SPOP-215ENST00000509765 613 ntTSL 214.16□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 KCNAB2-211ENST00000445501 486 ntTSL 414.12□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 STAG2-212ENST00000458176 845 ntTSL 314.06□□□□□ -0.165e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SPOP-214ENST00000509079 1134 ntTSL 513.8□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SPOP-209ENST00000505581 984 ntTSL 513.8□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SPOP-204ENST00000502385 574 ntTSL 413.8□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 313.79□□□□□ -0.25e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.225e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 KCNAB2-216ENST00000478098 413 ntTSL 213.61□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.245e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.245e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 WBP2-208ENST00000588373 1374 ntTSL 213.52□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SPOP-218ENST00000513080 575 ntTSL 413.44□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 KCNAB2-215ENST00000472700 536 ntTSL 513.42□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 56.5
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