Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 DDIT3-201ENST00000346473 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.736e-165■■■■■ 568.3
PUM2Q8TB72 DDIT3-202ENST00000547303 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.816e-165■■■■■ 568.3
PUM2Q8TB72 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.46e-165■■■■■ 568.3
PUM2Q8TB72 DDIT3-206ENST00000623876 1151 nt6.21□□□□□ -1.426e-165■■■■■ 568.3
PUM2Q8TB72 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.234e-29■■■■■ 313.7
PUM2Q8TB72 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.144e-29■■■■■ 313.7
PUM2Q8TB72 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.24e-29■■■■■ 313.7
PUM2Q8TB72 SIPA1-204ENST00000528699 548 ntTSL 29.87□□□□□ -0.834e-29■■■■■ 313.7
PUM2Q8TB72 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.813e-23■■■■■ 290.8
PUM2Q8TB72 NINJ1-204ENST00000489274 2026 ntTSL 214.02□□□□□ -0.173e-23■■■■■ 290.8
PUM2Q8TB72 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.041e-323■■■■■ 243.9
PUM2Q8TB72 CCDC12-211ENST00000604367 2412 nt14.45□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 243.9
PUM2Q8TB72 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.491e-323■■■■■ 243.9
PUM2Q8TB72 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.531e-7■■■■■ 234.4
PUM2Q8TB72 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 234.4
PUM2Q8TB72 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 PTPN6-203ENST00000416215 2412 ntTSL 212.94□□□□□ -0.341e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 PTPN6-201ENST00000318974 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.491e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 PTPN6-209ENST00000537533 673 ntTSL 311.54□□□□□ -0.561e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 PTPN6-212ENST00000539029 705 ntTSL 39.15□□□□□ -0.941e-32■■■■■ 210.6
PUM2Q8TB72 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.55□□□□□ -22e-9■■■■■ 203.7
PUM2Q8TB72 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.525e-11■■■■■ 192.2
PUM2Q8TB72 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.114e-20■■■■■ 189.9
PUM2Q8TB72 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.114e-20■■■■■ 189.9
PUM2Q8TB72 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.074e-20■■■■■ 189.9
PUM2Q8TB72 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.034e-20■■■■■ 189.9
PUM2Q8TB72 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.474e-20■■■■■ 189.9
PUM2Q8TB72 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.43e-22■■■■■ 187.1
PUM2Q8TB72 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.483e-22■■■■■ 187.1
PUM2Q8TB72 HIRIP3-202ENST00000563053 1686 ntTSL 215.03■□□□□ -04e-16■■■■■ 175.9
PUM2Q8TB72 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.154e-16■■■■■ 175.9
PUM2Q8TB72 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.594e-16■■■■■ 175.9
PUM2Q8TB72 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.9■□□□□ 0.944e-17■■■■■ 173.4
PUM2Q8TB72 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.57□□□□□ -1.364e-17■■■■■ 173.4
PUM2Q8TB72 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.274e-17■■■■■ 166.7
PUM2Q8TB72 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-10■■■■■ 164.4
PUM2Q8TB72 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.482e-10■■■■■ 164.4
PUM2Q8TB72 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.759e-9■■■■■ 161.4
PUM2Q8TB72 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 520.86■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 158.3
PUM2Q8TB72 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 158.3
PUM2Q8TB72 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 158.3
PUM2Q8TB72 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 158.3
PUM2Q8TB72 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 158.3
PUM2Q8TB72 COQ8A-206ENST00000479852 1938 ntTSL 1 (best)20.82■□□□□ 0.927e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.257e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 COQ8A-207ENST00000485462 2141 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 214.07□□□□□ -0.167e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.27e-8■■■■■ 154.6
PUM2Q8TB72 RGS14-202ENST00000425155 2329 ntTSL 218.69■□□□□ 0.585e-22■■■■■ 148.7
PUM2Q8TB72 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.275e-22■■■■■ 148.7
PUM2Q8TB72 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.155e-38■■■■■ 148.1
PUM2Q8TB72 BAP1-204ENST00000469613 1654 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.135e-38■■■■■ 148.1
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PUM2Q8TB72 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.174e-14■■■■■ 146
PUM2Q8TB72 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.24e-14■■■■■ 146
PUM2Q8TB72 ZFP64-212ENST00000477786 909 ntTSL 513.21□□□□□ -0.294e-14■■■■■ 146
PUM2Q8TB72 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.634e-14■■■■■ 146
PUM2Q8TB72 ZFP64-204ENST00000371515 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.764e-14■■■■■ 146
PUM2Q8TB72 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.578e-83■■■■■ 145.6
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PUM2Q8TB72 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.229e-8■■■■■ 144.4
PUM2Q8TB72 SFSWAP-208ENST00000539506 3149 ntTSL 512□□□□□ -0.499e-8■■■■■ 144.4
PUM2Q8TB72 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.094e-13■■■■■ 142.6
PUM2Q8TB72 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.094e-13■■■■■ 142.6
PUM2Q8TB72 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.234e-13■■■■■ 142.6
PUM2Q8TB72 PRF1-204ENST00000639390 523 ntTSL 510.4□□□□□ -0.744e-13■■■■■ 142.6
PUM2Q8TB72 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.428e-15■■■■■ 141.3
PUM2Q8TB72 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.3□□□□□ -1.46e-28■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 NRDE2-208ENST00000557732 623 ntTSL 211.28□□□□□ -0.64e-16■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 NRDE2-209ENST00000612614 3538 nt11.09□□□□□ -0.634e-16■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 NRDE2-202ENST00000553409 3434 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.684e-16■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 NRDE2-205ENST00000556189 2937 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.694e-16■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.554e-16■■■■■ 140
PUM2Q8TB72 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.26e-33■■■■■ 139.9
PUM2Q8TB72 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.26e-33■■■■■ 139.9
PUM2Q8TB72 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.113e-12■■■■■ 138.8
PUM2Q8TB72 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.293e-12■■■■■ 138.8
PUM2Q8TB72 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-17■■■■■ 138.4
PUM2Q8TB72 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-17■■■■■ 138.4
PUM2Q8TB72 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.852e-17■■■■■ 138.4
PUM2Q8TB72 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-17■■■■■ 138.4
PUM2Q8TB72 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-17■■■■■ 138.4
PUM2Q8TB72 TRIR-204ENST00000591254 988 ntTSL 223.29■■□□□ 1.321e-323■■■■■ 137.8
PUM2Q8TB72 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.941e-323■■■■■ 137.8
PUM2Q8TB72 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.91e-323■■■■■ 137.8
PUM2Q8TB72 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.841e-323■■■■■ 137.8
PUM2Q8TB72 TRIR-203ENST00000589590 930 ntTSL 216.14■□□□□ 0.171e-323■■■■■ 137.8
PUM2Q8TB72 DGKD-204ENST00000430834 5379 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.072e-32■■■■■ 136.3
PUM2Q8TB72 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.332e-32■■■■■ 136.3
PUM2Q8TB72 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-32■■■■■ 136.3
PUM2Q8TB72 CASP8AP2-204ENST00000548224 1300 ntTSL 513.96□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 134.6
PUM2Q8TB72 CASP8AP2-201ENST00000237177 6719 ntTSL 57.41□□□□□ -1.222e-9■■■■■ 134.6
PUM2Q8TB72 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 133.4
PUM2Q8TB72 AGAP3-203ENST00000461065 1707 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 133.4
PUM2Q8TB72 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 133.4
PUM2Q8TB72 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 133.4
PUM2Q8TB72 AGAP3-212ENST00000473633 3751 ntTSL 1 (best)8.98□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 133.4
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