RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576154.5

SCPEP1-215, Transcript of serine carboxypeptidase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SCPEP1, Length 1,915 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1-215ENST00000576154 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.93■■■■□ 3.66
SCPEP1-215ENST00000576154 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.04■■■□□ 2.88
SCPEP1-215ENST00000576154 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
SCPEP1-215ENST00000576154 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.37■■■□□ 2.61
SCPEP1-215ENST00000576154 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.28■■■□□ 2.6
SCPEP1-215ENST00000576154 ABCC9O60706 1549 aa31.16■■■□□ 2.58
SCPEP1-215ENST00000576154 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31■■■□□ 2.55
SCPEP1-215ENST00000576154 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.97■■■□□ 2.55
SCPEP1-215ENST00000576154 NACADO15069 1562 aa30.75■■■□□ 2.51
SCPEP1-215ENST00000576154 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.47■■■□□ 2.47
SCPEP1-215ENST00000576154 SCRIBQ14160 1630 aa30.4■■■□□ 2.46
SCPEP1-215ENST00000576154 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SCPEP1-215ENST00000576154 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.85■■■□□ 2.37
SCPEP1-215ENST00000576154 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.54■■■□□ 2.32
SCPEP1-215ENST00000576154 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.46■■■□□ 2.31
SCPEP1-215ENST00000576154 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
SCPEP1-215ENST00000576154 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
SCPEP1-215ENST00000576154 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.3■■■□□ 2.28
SCPEP1-215ENST00000576154 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
SCPEP1-215ENST00000576154 SMARCA4P51532 1647 aa29.14■■■□□ 2.26
SCPEP1-215ENST00000576154 WIZO95785 1651 aa29.07■■■□□ 2.24
SCPEP1-215ENST00000576154 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.79■■■□□ 2.2
SCPEP1-215ENST00000576154 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SCPEP1-215ENST00000576154 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
SCPEP1-215ENST00000576154 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.64■■■□□ 2.18
SCPEP1-215ENST00000576154 SMARCA2P51531 1590 aa28.64■■■□□ 2.18
SCPEP1-215ENST00000576154 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.61■■■□□ 2.17
SCPEP1-215ENST00000576154 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
SCPEP1-215ENST00000576154 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.48■■■□□ 2.15
SCPEP1-215ENST00000576154 NCAPD3P42695 1498 aa28.37■■■□□ 2.13
SCPEP1-215ENST00000576154 HMGXB3Q12766 1538 aa28.36■■■□□ 2.13
SCPEP1-215ENST00000576154 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.21■■■□□ 2.11
SCPEP1-215ENST00000576154 TRIM41Q8WV44 630 aa28.08■■■□□ 2.09
SCPEP1-215ENST00000576154 ABCC8Q09428 1581 aa27.92■■■□□ 2.06
SCPEP1-215ENST00000576154 CFTRP13569 1480 aa27.78■■■□□ 2.04
SCPEP1-215ENST00000576154 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
SCPEP1-215ENST00000576154 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.66■■■□□ 2.02
SCPEP1-215ENST00000576154 PRDM2Q13029 1718 aa27.65■■■□□ 2.02
SCPEP1-215ENST00000576154 SYNJ1O43426 1573 aa27.61■■■□□ 2.01
SCPEP1-215ENST00000576154 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
SCPEP1-215ENST00000576154 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.51■■■□□ 2
SCPEP1-215ENST00000576154 TOP2BQ02880 1626 aa27.5■■□□□ 1.99
SCPEP1-215ENST00000576154 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.47■■□□□ 1.99
SCPEP1-215ENST00000576154 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.44■■□□□ 1.98
SCPEP1-215ENST00000576154 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.41■■□□□ 1.98
SCPEP1-215ENST00000576154 SOGA1O94964 1423 aa27.4■■□□□ 1.98
SCPEP1-215ENST00000576154 CUX1P39880 1505 aa27.4■■□□□ 1.98
SCPEP1-215ENST00000576154 EEA1Q15075 1411 aa27.38■■□□□ 1.97
SCPEP1-215ENST00000576154 NESP48681 1621 aa27.38■■□□□ 1.97
SCPEP1-215ENST00000576154 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.36■■□□□ 1.97
SCPEP1-215ENST00000576154 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.28■■□□□ 1.96
SCPEP1-215ENST00000576154 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.2■■□□□ 1.95
SCPEP1-215ENST00000576154 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.2■■□□□ 1.94
SCPEP1-215ENST00000576154 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.19■■□□□ 1.94
SCPEP1-215ENST00000576154 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.16■■□□□ 1.94
SCPEP1-215ENST00000576154 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.14■■□□□ 1.93
SCPEP1-215ENST00000576154 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.09■■□□□ 1.93
SCPEP1-215ENST00000576154 TOPBP1Q92547 1522 aa27.07■■□□□ 1.92
SCPEP1-215ENST00000576154 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.06■■□□□ 1.92
SCPEP1-215ENST00000576154 KIF27Q86VH2 1401 aa27.03■■□□□ 1.92
SCPEP1-215ENST00000576154 KIF21BO75037 1637 aa27.02■■□□□ 1.92
SCPEP1-215ENST00000576154 GOLGA3Q08378 1498 aa27.01■■□□□ 1.91
SCPEP1-215ENST00000576154 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
SCPEP1-215ENST00000576154 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
SCPEP1-215ENST00000576154 CUX2O14529 1486 aa26.93■■□□□ 1.9
SCPEP1-215ENST00000576154 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.93■■□□□ 1.9
SCPEP1-215ENST00000576154 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SCPEP1-215ENST00000576154 PRXQ9BXM0 1461 aa26.86■■□□□ 1.89
SCPEP1-215ENST00000576154 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.86■■□□□ 1.89
SCPEP1-215ENST00000576154 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.86■■□□□ 1.89
SCPEP1-215ENST00000576154 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.85■■□□□ 1.89
SCPEP1-215ENST00000576154 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.84■■□□□ 1.89
SCPEP1-215ENST00000576154 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.84■■□□□ 1.89
SCPEP1-215ENST00000576154 CEP162Q5TB80 1403 aa26.8■■□□□ 1.88
SCPEP1-215ENST00000576154 WDR97A6NE52 1622 aa26.76■■□□□ 1.87
SCPEP1-215ENST00000576154 IGF1RP08069 1367 aa26.75■■□□□ 1.87
SCPEP1-215ENST00000576154 ERCC6Q03468 1493 aa26.73■■□□□ 1.87
SCPEP1-215ENST00000576154 WDR62O43379 1518 aa26.7■■□□□ 1.87
SCPEP1-215ENST00000576154 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SCPEP1-215ENST00000576154 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.63■■□□□ 1.85
SCPEP1-215ENST00000576154 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.63■■□□□ 1.85
SCPEP1-215ENST00000576154 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SCPEP1-215ENST00000576154 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SCPEP1-215ENST00000576154 CLIP1P30622 1438 aa26.58■■□□□ 1.85
SCPEP1-215ENST00000576154 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.57■■□□□ 1.84
SCPEP1-215ENST00000576154 CUL7Q14999 1698 aa26.57■■□□□ 1.84
SCPEP1-215ENST00000576154 IFT140Q96RY7 1462 aa26.53■■□□□ 1.84
SCPEP1-215ENST00000576154 PBRM1Q86U86 1689 aa26.42■■□□□ 1.82
SCPEP1-215ENST00000576154 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SCPEP1-215ENST00000576154 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
SCPEP1-215ENST00000576154 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SCPEP1-215ENST00000576154 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.36■■□□□ 1.81
SCPEP1-215ENST00000576154 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.36■■□□□ 1.81
SCPEP1-215ENST00000576154 GRIN2BQ13224 1484 aa26.35■■□□□ 1.81
SCPEP1-215ENST00000576154 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SCPEP1-215ENST00000576154 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SCPEP1-215ENST00000576154 ARAP1Q96P48 1450 aa26.3■■□□□ 1.8
SCPEP1-215ENST00000576154 ADAMTS12P58397 1594 aa26.29■■□□□ 1.8
SCPEP1-215ENST00000576154 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.28■■□□□ 1.8
SCPEP1-215ENST00000576154 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.28■■□□□ 1.8
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